فهرست نامه‌ی حاضر بر اساس روش ترکیبی (الفبایی ـ موضوعی) تنظیم شده است. بدین ترتیب که ابتدا نسخه‌ها در هشت موضوع قرآن و علوم قرآنی، حدیث و علوم حدیث، تاریخ و فضایل اهل بیت (ع)، ادبیات عربی و فارسی و ترکی، فقه و اصول فقه، علوم عقلی و علوم دیگر تقسیم شده، پس از آن عنوان‌ها به صورت الفبایی در ذیل هر موضوع معرفی شده است. هر عنوان کتاب، در دو بخش کتاب شناسی و نسخه شناسی معرفی گردیده است. در بخش کتاب‌شناسی، اطلاعات مربوط به کتاب، شامل عنوان کتاب، زبان کتاب، مولف، کتاب‌شناسی، مصادر کتاب شناسی و آغاز و انجام کتاب، درج گردیده است و در بخش نسخه‌شناسی، اطلاعات مربوط به نسخه‌ها شامل شماره‌ی کتاب در مخزن کتابخانه، مباحث نسخه، آسیب دیدگی‌ها، آغاز و انجام نسخه، نوع خط، نام کاتب، تاریخ کتابت، محل کتابت، آرایه‌های نسخه، مشخصات نسخه‌شناسی، شماره‌ی نسخه، تعداد برگ‌ها و سطور، اندازه و مشخصات جلد نسخه، ذکر گردیده است.
