سازمان صنایع کوچک و شهرکهای صنعتی ایران در شهریور ماه 1382 بر اساس مصوبه شورای عالی اداری تشکیل گردیده است. این سازمان از ادغام سازمان صنایع کوچک ایران و شرکت شهرکهای صنعتی ایران به وجود آمده است و بصورت شرکت دولتی اداره می شود. سازمان صنایع کوچک ایران در سال 1380 و پس از تشکیل وزارت صنایع و معادن ایجاد شده بود و شرکت شهرکهای صنعتی ایران با هدف ایجاد هماهنگی و استفاده مطلوب از امکانات زیر بنائی و ارائه خدمات مناسب و ضروری برای متقاضیان سرمایه گذاری در زمینه تولیدات صنعتی با تصویب مجلس شورای اسلامی در سال 1363 ایجاد گردیده بود.